元太科技甚為重視員工的安全與健康，首要就是要建立一個健康、安全及舒適的工作環境，透過改善工作的環境並降低職業病發生的機會；此外，企業要永續經營必須以安全衛生及環保為考量，藉由適當的評量工具，提出管理方案並落實到日常運作之中，秉持安全衛生及環保與企業發展並重的理念，方能達到企業永續經營的目的。
職業安全衛生管理系統認證
元太科技自2002 年起陸續通過OHSAS 18001 職業安全衛生管理系統認證、TOSHMS台灣職業安全衛生管理系統認證等，並於2020 年通過ISO 45001 職業安全衛生管理系統轉版取得證書，以進一步保障員工及承攬商工作安全。而揚州廠則規劃2023 年通過ISO 45001 認證取得證書。
元太科技已建立完善緊急事故處理流程，每年皆依循法規等相關要求，定期辦理各項安全演練，讓所有人員皆能熟悉緊急事故通報、應變處理及避難流程，進而降低真正事故發生時可能造成的衝擊程度。2021 年於台灣廠區及揚州廠共辦理28 場次演練。
員工工傷及失能傷害統計分析
元太科技依職業安全衛生法職業災害定義及全球永續性報告協會（Global Reporting Initiative, GRI）所公布之重要失能傷害統計指標計算，以工傷率、失能傷害頻率（Disabling Frequency Rate, FR）、失能傷害嚴重率（Disabling Severity Rate, SR）為主要數據分析，透過擬定改善措施，維護員工工作安全。而新竹廠及林口廠陸續加入「零災害工時紀錄」之挑戰，以表示公司對降低災害的決心。
